Kesan penggunaan pel mikrofiber dalam kawalan jangkitan telah terdokumentasi dengan baik dan menjadikannya alat penting dalam persekitaran penjagaan kesihatan. Kajian menunjukkan bahawa penggunaan pel mikrofiber boleh menghilangkan sehingga 99% bakteria dari permukaan jika digunakan dengan betul, berbanding peratusan yang jauh lebih rendah bagi pel konvensional. Pel tradisional sering direndam dalam air kotor, menjadi tempat pembiakan bakteria yang kemudian tersebar ke seluruh lantai pada setiap sapuan berikutnya. Sistem mikrofiber mengurangkan risiko ini melalui penggunaan pelbagai alas dan kaedah dua baldi (satu untuk air bersih, satu lagi untuk memerah air kotor), atau menggunakan troli yang lebih canggih yang membekalkan alas bersih dan secara automatik mengutip alas terpakai. Ini memastikan alas yang baru dan berkesan digunakan untuk setiap bilik atau kawasan tertentu. Keupayaan untuk mencuci alas mikrofiber pada suhu tinggi turut memastikan pemusnahan patogen yang terperangkap. Dalam satu kajian kes di hospital, pelaksanaan sistem pel mikrofiber berwarna kod untuk bilik pesakit, koridor, dan dewan pembedahan dikaitkan dengan penurunan ketara kadar jangkitan berkaitan penjagaan kesihatan (HAI). Penyingkiran biofilem secara fizikal, iaitu lapisan pelindung yang menjadi tempat persembunyian bakteria, juga dicapai dengan lebih berkesan melalui tindakan abrasi mikrofiber, menjadikan lantai tidak sahaja kelihatan bersih tetapi benar-benar bersih dari segi higiene.