רכיב חשוב, אך לעתים קרובות מוזנח, בתוכנית איסוף מיקרו-סיבים מוצלחת הוא תהליך הכביסה. כיבסה לא נכונה עלולה להרוס במהירות את הסיבים, לסתום את החללים ביניהם עם שאריות ולהוביל להצפת זיהום. על פי שיטות עבודה מומלצות, כדאי להכבס פדים ממיקרו-סיבים בנפרד מטקסטיל אחר, כדי למנוע שצמר גפן מסדינים מקוטן יסתום את הסיבים. יש להימנע משימוש בסבונים אגרסיביים, רכותנים או לבנים, כיוון שחומרים אלו יכולים לכסות את הסיבים, להפחית את המטען האלקטרוסטטי ואת היכולת לספוג. מומלץ להשתמש בסבון עם pH ניטרלי שתוכנן במיוחד למיקרו-סיבים. גם טמפרטורת המים חשובה; כיבסה חמה ואחריה שטיפה מדויקת הן האידיאליות. ייבוש בטמפרטורה גבוהה עלול לפגוע בסיבים ולמיס את חומר האיחוד, ולכן מועדף ייבוש באוויר או ייבוש במגבים בטמפרטורה נמוכה. מתקנים עם פעולות בקנה מידה גדול נוטים לשתף פעולה עם שירותי שכירות טקסטיל מקצועיים שמספקים מערכת מחזור סגורה: אספקה של פדים נקיים ומאושרים, ואיסוף של פדים משומשים לכביסה תעשייתית בתנאים מבוקרים. זה מבטיח ביצועים עקביים, אחריות על היגיינה ופשטת ניהול המלאי למשתמש הסופי, ועושה את כל מערכת האיסוף אמינה ויעילה יותר.