Účinnosť mikrovláknových mopov pri kontrole infekcií je dobre zdokumentovaná a robí z nich kľúčový nástroj v zdravotníckych zariadeniach. Štúdie preukázali, že použitie mikrovláknových mopov môže odstrániť až 99 % baktérií z povrchu, pokiaľ sú správne použité, oproti výrazne nižšiemu percentu pri bežných mopoch. Tradičné moppy často stojia v špinavej vode a stávajú sa tak rezervoármi baktérií, ktoré sú následne šírené po podlahe pri každom ďalšom prejazde. Mikrovláknové systémy tento riziku znížia použitím viacerých utierok a dvojkyblenovej metódy (jeden kbelец na čistú vodu, druhý na vyžmýmanie špinavej vody), alebo ešte pokročilejšími vozíkmi, ktoré rozdávajú čisté utierky a automaticky zbierajú použité. Tým sa zabezpečí, že pre každú miestnosť alebo určenú oblasť sa použije čerstvá a účinná utierka. Možnosť prať mikrovláknové utierky pri vysokých teplotách ďalej zaručuje elimináciu zachytených patogénov. V prípadovej štúdii nemocnice bol zavedený farebne kódovaný mikrovláknový mopačský systém pre pacientske izby, chodby a operačné sály, čo korelovalo so zmerateľným znížením frekvencie nosokomiálnych infekcií (HAI). Fyzické odstránenie biofilmov, ktoré sú ochrannými vrstvami ukrývajúcimi baktérie, je tiež efektívnejšie dosiahnuteľné abrazívnym pôsobením mikrovlákna, čo zabezpečuje, že podlahy sú čisté nielen vizuálne, ale aj hygienicky.