Მიკრობაგის შლანგების ეფექტურობა ინფექციების კონტროლში კარგად არის დოკუმენტირებული და ხდის მათ გადამწყვეტ ინსტრუმენტად ჯანდაცვის დაწესებულებებში. კვლევებმა აჩვენა, რომ მიკრობაგის შლანგების სწორად გამოყენების შემთხვევაში ისინი ზედაპირიდან ამოიღებენ ბაქტერიების 99%-მდე რაოდენობას, ხოლო ტრადიციული შლანგების შემთხვევაში ეს მაჩვენებელი მნიშვნელოვნად ნაკლებია. ტრადიციული შლანგები ხშირად იმყოფებიან ბინძურ წყალში, რის შედეგადაც თავიდან ხდებიან ბაქტერიების საცავები, რომლებიც შემდგომი გადაადგილებისას ვრცელდება იატაკზე. მიკრობაგის სისტემები ამ რისკს ამცირებენ მრავალი პადის გამოყენებით და ორი ყუთის მეთოდით (ერთი სუფთა წყლისთვის, მეორე – ბინძურის გასაწმენდად), ან კიდევ უფრო მოდერნიზებული ტევრებით, რომლებიც ამოაქვთ სუფთა პადები და ავტომატურად აგროვებენ გამოყენებულებს. ეს უზრუნველყოფს იმას, რომ თითოეული ოთახის ან განსაზღვრული ზონისთვის გამოყენებული იქნეს სუფთა და ეფექტური პადი. მიკრობაგის პადების მაღალ ტემპერატურაზე გამოსახება კიდევ უფრო უზრუნველყოფს დაპყრობილი პათოგენების განადგურებას. ერთ-ერთ ჰოსპიტალში ჩატარებულმა შემთხვევაზე დაფუძნებულმა კვლევამ აჩვენა, რომ პაციენტების ოთახების, და მისასვლელების, ასევე ოპერაციულებისთვის ფერადი კოდირებული მიკრობაგის შლანგების სისტემის გამოყენება დაკავშირებული იყო ჯანდაცვის დაწესებულებებში მიღებული ინფექციების (HAI) დადგენილი დონის შემცირებასთან. ბიოლოგიური სიმკვრივეების, რომლებიც ბაქტერიების დამალვის დამცავ ფენებს წარმოადგენენ, ფიზიკური ამოშლა მიკრობაგის აბრაზიული მოქმედებით უფრო ეფექტურად ხდება, რაც იატაკებს ხდის არა მხოლოდ ვიზუალურად სუფთას, არამედ ჰიგიენურად სუფთას.