Ефективността на шлюшковете от микровлакно при контрола на инфекциите е добре документирана и ги прави от съществено значение в здравните среди. Проучванията показват, че при правилна употреба шлюшковете от микровлакно могат да премахнат до 99% от бактериите от повърхност, докато традиционните шлюшкове премахват значително по-малък процент. Традиционните шлюшкове често стоят в мръсна вода и се превръщат в резервоари за бактерии, които след това се разпространяват по пода при всяко следващо движение. Системите с микровлакно намаляват този риск чрез използването на множество подложки и двукошов метод (един кош за чиста вода, друг за изстискване на мръсната вода) или още по-напреднали колички, които подават чисти подложки и автоматично събират използваните. Това гарантира, че за всяка стая или определена зона се използва нова и ефективна подложка. Възможността за пране на подложките от микровлакно при високи температури допълнително осигурява унищожаването на уловените патогени. В случайно проучване в болница прилагането на цветово кодирана система за миене с микровлакно за пациентски стаи, коридори и операционни зали беше свързано с измеримо намаляване на случаите на болнични инфекции (БИ). Физическото премахване на биоплесени, които са защитни слоеве, пазещи бактериите, също се постига по-ефективно с абразивното действие на микровлакното, като така подовете не просто изглеждат чисти, а са хигиенично чисти.