Skuteczność mopów mikrofibry w kontroli zakażeń jest dobrze udokumentowana i czyni je kluczowym narzędziem w placówkach medycznych. Badania wykazały, że prawidłowe stosowanie mopów mikrofibry pozwala usunąć nawet do 99% bakterii z powierzchni, w porównaniu do znacznie niższego odsetka osiąganego przez tradycyjne mopy. Konwencjonalne mopy często leżą w brudnej wodzie, stając się rezerwuarami bakterii, które następnie są rozprzestrzeniane po podłodze przy każdym kolejnym przemywaniu. Systemy mikrofibry ograniczają to ryzyko poprzez użycie wielu wkładów oraz metody dwóch wiader (jedno z czystą wodą, drugie do wykręcania brudnej wody), a jeszcze bardziej zaawansowane wózki automatycznie dostarczają czyste wkłady i zbierają używane. Zapewnia to, że świeży i skuteczny wkład jest używany w każdym pomieszczeniu lub wydzielonym obszarze. Możliwość prażenia wkładów mikrofibry w wysokich temperaturach dalszych zapewnia eliminację przechwyconych patogenów. W badaniu przypadku szpitalnego wprowadzenie kolorowego systemu mopowania mikrofibry dla pokoi pacjentów, korytarzy i sal operacyjnych skorelowano ze zmniejszeniem liczby zakażeń związanych z opieką zdrowotną (HAI). Skuteczniejsze jest również fizyczne usuwanie biofilmów – ochronnych warstw tworzonych przez bakterie – dzięki ścieralnemu działaniu mikrofibry, co sprawia, że podłogi są nie tylko wizualnie czyste, ale także higienicznie czyste.