Efikasiteti i mopave me mikrofibër në kontrollin e infeksioneve është mirë dokumentuar dhe i bën ato një mjet të rëndësishëm në mjediset shëndetësore. Studimet kanë treguar se përdorimi i mopave me mikrofibër mund të heqë deri në 99% të baktereve nga një sipërfaqe, kur përdoren në mënyrë të duhur, krahasuar me një përqindje shumë më të ulët për mopat konvencionalë. Mopat tradicionale shpesh qëndrojnë në ujë të ndyrë, duke u bërë rezervuare për bakteret që më pas përhapen mbi dysheme me çdo levizje të ardhshme. Sistemet me mikrofibër zvogëlojnë këtë rrezik përmes përdorimit të disa fashëve dhe një metode me dy gara (një për ujë të pastër, një për shtypjen e ujit të ndyrë), ose edhe karroca më të sofistikuara që nxjerrin fasha të reja dhe mbledhin automatikisht ato të përdorura. Kjo garanton që një fashë e re dhe efektive të përdoret për çdo dhomë apo zonë të përcaktuar. Mundësia për t’i larë fashat e mikrofibrit në temperatura të larta siguron më tej eliminimin e patogjeneve të kapur. Në një studim rastësor në një spital, zbatimin e një sistemi me mop me mikrofibër me kod ngjyrash për dhomat e pacientëve, korridoret dhe teatrot kirurgjikore iu atribua një reduktim i matshëm i shkallës së infeksioneve të lidhura me kujdesin shëndetësor (HAI). Zhdukja fizike e biofilmeve, që janë shtresa mbrojtëse që strehohen në to bakteret, arrin gjithashtu më efektivisht me veprimin abrasiv të mikrofibrit, duke bërë që dyshemet të jenë jo vetëm vizualisht të pastër, por edhe higjenikisht të pastër.