Eficiența mopurilor din microfibră în controlul infecțiilor este bine documentată și le face un instrument esențial în unitățile medicale. Studiile au demonstrat că utilizarea corectă a mopurilor din microfibră poate elimina până la 99% din bacterii de pe o suprafață, comparativ cu un procent semnificativ mai mic în cazul mopurilor clasice. Mopurile tradiționale stau adesea în apă murdară, devenind rezervoare pentru bacterii care sunt apoi răspândite pe podea la fiecare trecere ulterioară. Sistemele cu microfibră reduc acest risc prin utilizarea mai multor plăci și a unei metode cu două găleți (una pentru apă curată, una pentru stoarcerea apei murdare), sau chiar a unor cărucioare mai avansate care distribuie plăci curate și colectează automat cele folosite. Acest lucru asigură utilizarea unei plăci noi și eficiente pentru fiecare cameră sau zonă delimitată. Posibilitatea de a spăla plăcile din microfibră la temperaturi ridicate asigură în continuare eliminarea patogenilor capturați. Într-un studiu de caz într-un spital, implementarea unui sistem de mopuri din microfibră codificate prin culori pentru camerele pacienților, coridoare și săli de operație a fost asociată cu o reducere măsurabilă a ratei infecțiilor asociate îngrijirii medicale (HAI). Eliminarea fizică a biofilmelor, care sunt straturi protectoare ce adăpostesc bacteriile, este de asemenea realizată mai eficient datorită acțiunii abrasive a microfibrei, făcând ca podelele să fie nu doar curate vizual, ci și igienic.